Le Muséum national d’histoire naturelle est référent scientifique des TAAF depuis 1979 pour le suivi des pêcheries australes à Kerguelen, Crozet et Saint-Paul et Amsterdam.
L’IRD est partenaire scientifique des TAAF pour les pêcheries aux thons et autres espèces pélagiques dans les îles Éparses et l’océan Indien depuis 2007.
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